Vannområdene brukes som en enhet i vannforvaltningen og har en viktig rolle i å følge opp EUs vanndirektiv gjennom vannforskriften. Hvert vannområde har en vannområdekoordinator som samarbeider med kommunene og andre aktører for å sikre at miljømålene for vannforekomstene blir oppnådd.
Når vannet renner gjennom terrenget, følger det ikke kommune- eller fylkesgrenser. Vannområdene er derfor delt inn etter nedbørsfelt for å følge vannet og sikre en helhetlig forvaltning av vannforekomstene.
Vannforekomstene i Horten kommune tilhører tre forskjellige vannområder, som vist i figuren nedenfor.
Horten-Larvik vannområde:
Dette vannområdet omfatter alle mindre bekker som renner til fjorden mellom Horten og Larvik. I Horten gjelder dette bekkene som renner til Borrevannet; Semb hovedgård, Vassbånn, Sandevassdraget fra Nykirke til Ra (inkludert Adalstjern), samt utløpet fra Borrevannet ved Falkensten.
Aulivassdraget vannområde:
Omfatter Undrumsdalbekken som renner til Aulivassdraget i Tønsberg.
Breiangen vest vannområde:
Omfatter bekkene som renner ut i Frebergsvik.